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特别是在基因组大小、基因移动和异染色质进化等方面新的分子机制

来源:未知作者:admin 更新时间:2019-04-20 11:29
本报讯 (记者刘传书)3月13日,由中科院遗传与发育所、华大基因及亚利桑那大学等单元合作完成的短花药野生稻基因组学研究功效在《天然·通信》杂志上在线颁发。研究为稻属的比力、进化和功能基因组学研究供给了贵重资本。 研究人员操纵新一代测序手艺测定了

  本报讯 (记者刘传书)3月13日,由中科院遗传与发育所、华大基因及亚利桑那大学等单元合作完成的短花药野生稻基因组学研究功效在《天然·通信》杂志上在线颁发。研究为稻属的比力、进化和功能基因组学研究供给了贵重资本。

  研究人员操纵新一代测序手艺测定了高质量的短花药野生稻全基因组序列,并将96%的基因组序列定位到12条染色体上。通过比力基因组学阐发发觉,在短花药野生稻基因组中,转座子的活性较低并不竭的从基因组中被删除,从而导致该基因组维持较小的形态;此外,水稻基因组中还具有着大量的基因反复,这些基因可能是通过串联基因反复或者基因转移的机制在基因组中不竭进行扩增。通过度析短花药野生稻和水稻基因组中的异染色质区域,研究人员发觉基因反复不只能够添加基因的拷贝,同时这些冗余的序列还能够作为反复序列扩增的热点,这对异染色质的构成和维持有着主要意义。

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  华大基因该项目担任人黄铨飞暗示:“本研究揭示了稻属基因组进化,出格是在基因组大小、基因挪动和异染色质进化等方面新的分子机制。将来,稻属将会有更多的代表性物种基因组序列发布,这将使稻属成为一个更好的处置动物功能和进化基因组学研究的系统。”

  野生稻包含着贵重的基因资本。短花药野生稻是稻属中与水稻亲缘关系较远的一类野生稻,具有对多种水稻病原菌和一些非生物勒迫较好的抗性。通过比力短花药野生稻、水稻及其他野生稻的基因组,研究者能够获得稻属进化过程中发生的基因组变异消息,从而愈加精确的理解水稻基因组的布局和进化过程。

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